(1)對(duì)不含氮的有機(jī)物分解

自然界中大多數(shù)微生物只能利用葡萄糖、麥芽糖等基本糖類，而對(duì)于利用纖維素、油脂等的微生物種類較少。通常對(duì)不含氮有機(jī)物的降解主要是靠某些特定的微生物將大分子物質(zhì)分解為小分子物質(zhì)，再通過細(xì)菌、霉菌等對(duì)小分子進(jìn)行利用。對(duì)于葡萄糖等簡(jiǎn)單糖類的分解主要是一些常見的微生物，比如酵母、芽孢等;對(duì)于脂肪分解主要是靈桿菌、放線菌、霉菌或者熒光桿菌等微生物;對(duì)于芳香族化合物主要是通過白腐菌、某些光合細(xì)菌進(jìn)行有效降解。

(2)對(duì)于含氮物質(zhì)的分解

污水中主要的含氮物質(zhì)是氨氮、尿素、氨基酸、蛋白質(zhì)、硝酸鹽等物質(zhì)。對(duì)于尿素的分解主要是一些尿素細(xì)菌，比如桿狀菌、球狀菌等進(jìn)行尿素水解;對(duì)于蛋白質(zhì)的分解，主要通過熒光假單胞菌將蛋白質(zhì)分解為氨基酸。

在分解的每個(gè)階段都有特定的微生物參與，比如氨化的作用主要是一些好氧細(xì)菌和厭氧細(xì)菌，硝化的作用主要是好氧細(xì)菌，反硝化作用則是一些兼性厭氧微生物。

(3)對(duì)無機(jī)物的轉(zhuǎn)換

污水中一般含硫、磷和鐵等無機(jī)物，對(duì)于硫元素的處理主要是依靠硫磺細(xì)菌和硫化細(xì)菌來將硫元素進(jìn)行轉(zhuǎn)化，對(duì)于磷元素主要是通過一些蠟質(zhì)芽孢桿菌來處理，對(duì)于鐵元素的處理主要是通過微生物的氧化還原作用進(jìn)行處理。有的工業(yè)廢水和畜禽養(yǎng)殖污水中還含有鉻、銅等重金屬，比如冶金、醫(yī)藥等廢水中含有多種重金屬，養(yǎng)殖污水由于飼料添加劑銅類化合物的廣泛使用，常造成養(yǎng)殖污水中銅元素超標(biāo)。重金屬不能被分解，對(duì)于重金屬的處理只能是將其轉(zhuǎn)化成鈍化態(tài)或?qū)⑵滢D(zhuǎn)移。微生物在轉(zhuǎn)化重金屬方面具有重要作用，比如鎘元素一般采用微生物吸附、還原的方法來處理。